あらゆるベンチでの染色の自動化により、より優れた再現性のある組織イメージングを実現
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あらゆるベンチでの染色の自動化により、より優れた再現性のある組織イメージングを実現

Apr 22, 2023

Parhelia Omni-Stainer™ は試薬コストを削減しながら空間生物学プロトコルを自動化します

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腫瘍微小環境は、がん細胞、免疫細胞、間質細胞、および細胞外マトリックス成分の複雑な集合体です。 これらの成分間の相互作用は、腫瘍の増殖と治療に対する反応に大きな影響を与える可能性があります。 空間生物学時代の到来により、腫瘍の微小環境をマッピングする能力に一定の進歩がもたらされました。現在では、さまざまな高度に多重化されたイメージング技術が数十の細胞型をその場でマッピングするために使用され、高度な計算アルゴリズムが腫瘍内でのそれらの関係を定量的にモデル化するために使用されています。コンテクスト。 これらの多段階プロトコルは非常に高価であり、サンプル処理量に厳しい制限があり、アッセイにばらつきが生じやすいため、複数の研究室間で採用および標準化することが困難です。

Parhelia のビジョンは、個々のベンチレベルでの責任ある自動化の実装によって研究のコンプライアンス、再現性、堅牢性が達成される、再現可能な生物学の新時代の到来を導くことです。 このビジョンでは、プロトコルは、個別のトレーニングや骨の折れる試行錯誤のリバース エンジニアリングを通じてではなく、ボタンを押すだけで展開できるダウンロード可能なオープンソース自動化スクリプトを共有することによって、ラボ間で共有されます。 研究者に、複雑なプロトコルの核心的な詳細に関する多くの場合暗黙の知識を正確かつ明示的なロボットコマンドに変換することを強制することで、迅速な普及、容易な採用、バージョン管理、および同業者コミュニティによる新しいプロトコルの独立した検証が可能になります。

この未来を実現し、空間生物学研究における山積する課題に対処するために、Parhelia Biosciences は、大量の空間アッセイをシームレスに導入できる画期的な組織染色ワークステーションである Omni-Stainer™ を開発しました。 これまでのかさばる組織学用自動染色装置とは異なり、Parhelia Omni-Stainer™ はコンパクトなベンチトップ デバイスであり、意図的に中規模の研究室の CapEx 予算制限内 (<15,000 ドル) 内に収まるように価格設定されています。

Parhelia Omni-Stainer は、オープンソースの SBS 形式リキッド ハンドラーのシャーシ上に構築されたモジュール式機器です。 モジュールは、通常のスライドにマウントされたサンプルだけでなく、CODEX や smRNA-FISH などの空間アッセイで利用されることが増えているより珍しいカバースリップにマウントされたサンプルなど、さまざまな組織染色フォーマットに対応するように設計されています。

各モジュールは最大 12 個のサンプルを並行してホストし、Omni-Stainer にはそのようなモジュールを最大 10 個取り付けることができ、実行ごとに最大 120 個のサンプルのスループットが可能になります。 Omni-Stainer モジュールには、プログラムで制御されるペルチェ ブロックを取り付けることができ、0 ~ 99℃ の範囲で正確な温度制御が可能です。 これにより、ISH プロトコル、DNA ライゲーションと増幅、サイクリック IF および Opal などの TSA アッセイを含む、温度制御されたアッセイを Parhelia Omni-Stainer で展開することができます。

Omni-Stainer の主な特徴であるキャピラリーギャップ交換により、効率的かつ均一なサンプル染色が実現されます。 サンプルは60umの薄い液体の毛細管層の中でインキュベートされるため、DNA-抗体複合体やFISHプローブなどの高価な試薬の使用が大幅に削減されます。

Parhelia Omni-Stainer の比類のない柔軟性により、シンプルな Python API を介して任意の複雑なプロトコルを作成できます。 さらに、Parhelia はユーザーに StainWorks へのアクセスを提供します。StainWorks は、検証済みプロトコルの共有リポジトリを含む強力な Web アプリで、ユーザーはコードに触れることなく、これらのプロトコルを変更して実行できます。 現在、StainWorks には、IF、IHC、CODEX (PhenoCycle)、IMC、Opal、RNAScope の検証済みプロトコルが含まれており、リストは常に拡大しています。

Parhelia Omni-Stainer は、スタンフォード大学、ハーバード大学、ブロード大学、MD アンダーソン大学、メイヨー クリニック、WUSTL などの主要な研究機関や、ノバルティスやジェネンテックなどの製薬研究開発機関ですでに導入されています。

要約すると、Parhelia Omni-Stainer は空間生物学研究者にとって強力なツールであり、反復的な組織染色のマンネリから解放され、高価な試薬の使用を削減し、ボタンを押すだけで比類のない品質と再現性の組織染色を提供します。

詳細については、www.parheliabio.com をご覧ください。